1999年学校合并组建后，于当年11月，由原北京商学院成人教育、原北京轻工业学院成人教育和原机械管理干部学院成人教育合并成立了北京工商大学成人教育学院。2003年5月，成人教育学院更名为继续教育学院。2004年1月，教育培训中心和应用技术学院并入继续教育学院。